Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBL1P28749 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBL1P28749 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBL1P28749 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBL1P28749 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBL1P28749 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBL1P28749 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBL1P28749 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBL1P28749 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBL1P28749 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBL1P28749 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms