Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RXRBP28702 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RXRBP28702 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RXRBP28702 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RXRBP28702 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RXRBP28702 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRBP28702 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRBP28702 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRBP28702 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRBP28702 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRBP28702 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RXRBP28702 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRBP28702 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRBP28702 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRBP28702 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRBP28702 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRBP28702 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RXRBP28702 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RXRBP28702 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RXRBP28702 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RXRBP28702 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms