Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCD3P28288 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCD3P28288 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms