Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
POLR2AP24928 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR2AP24928 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms