Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRDP23468 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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