Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HRCP23327 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HRCP23327 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HRCP23327 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HRCP23327 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HRCP23327 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HRCP23327 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
HRCP23327 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HRCP23327 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HRCP23327 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HRCP23327 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
HRCP23327 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HRCP23327 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HRCP23327 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HRCP23327 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HRCP23327 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HRCP23327 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HRCP23327 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HRCP23327 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HRCP23327 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HRCP23327 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HRCP23327 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
HRCP23327 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HRCP23327 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HRCP23327 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HRCP23327 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HRCP23327 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
HRCP23327 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HRCP23327 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HRCP23327 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HRCP23327 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms