Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
S100A1P23297 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S100A1P23297 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S100A1P23297 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S100A1P23297 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S100A1P23297 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S100A1P23297 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms