Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RFX1P22670 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RFX1P22670 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFX1P22670 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFX1P22670 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFX1P22670 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFX1P22670 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX1P22670 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX1P22670 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms