Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKACGP22612 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKACGP22612 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms