Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNA5P22460 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA5P22460 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms