Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM1P18669 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGAM1P18669 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PGAM1P18669 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms