Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB2P17787 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms