Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATF7P17544 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATF7P17544 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATF7P17544 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATF7P17544 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATF7P17544 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF7P17544 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF7P17544 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF7P17544 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF7P17544 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATF7P17544 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATF7P17544 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATF7P17544 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATF7P17544 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms