Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CREB1P16220 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CREB1P16220 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB1P16220 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB1P16220 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB1P16220 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB1P16220 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB1P16220 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB1P16220 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB1P16220 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB1P16220 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms