Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCF4P15884 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCF4P15884 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF4P15884 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF4P15884 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF4P15884 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCF4P15884 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCF4P15884 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCF4P15884 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCF4P15884 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCF4P15884 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms