Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NME1P15531 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME1P15531 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME1P15531 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME1P15531 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME1P15531 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME1P15531 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME1P15531 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NME1P15531 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME1P15531 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NME1P15531 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME1P15531 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME1P15531 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms