Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLS3P13797 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLS3P13797 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLS3P13797 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLS3P13797 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLS3P13797 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLS3P13797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLS3P13797 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLS3P13797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLS3P13797 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLS3P13797 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLS3P13797 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLS3P13797 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms