Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA4P13612 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms