Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN1P12814 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms