Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMIGD3P0DMS9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMIGD3P0DMS9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms