Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GLI1P08151 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GLI1P08151 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GLI1P08151 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GLI1P08151 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GLI1P08151 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GLI1P08151 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLI1P08151 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLI1P08151 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLI1P08151 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GLI1P08151 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms