Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLBP06746 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLBP06746 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLBP06746 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLBP06746 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLBP06746 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLBP06746 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLBP06746 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLBP06746 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLBP06746 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms