Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT6BP04259 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms