Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGAP02671 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGAP02671 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGAP02671 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGAP02671 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FGAP02671 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGAP02671 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGAP02671 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGAP02671 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGAP02671 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGAP02671 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGAP02671 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGAP02671 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGAP02671 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGAP02671 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms