Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC2P02655 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC2P02655 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC2P02655 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC2P02655 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC2P02655 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC2P02655 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC2P02655 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC2P02655 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms