Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSTAP01040 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSTAP01040 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSTAP01040 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CSTAP01040 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTAP01040 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTAP01040 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTAP01040 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTAP01040 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTAP01040 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTAP01040 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms