Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX11BO96011 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX11BO96011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms