Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3BO95985 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms