Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR4O95473 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR4O95473 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms