Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG2O94898 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms