Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIOO75962 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIOO75962 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIOO75962 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIOO75962 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIOO75962 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIOO75962 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIOO75962 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOO75962 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOO75962 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms