Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DYSFO75923 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DYSFO75923 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DYSFO75923 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DYSFO75923 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DYSFO75923 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYSFO75923 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYSFO75923 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYSFO75923 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYSFO75923 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms