Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSDE1O75534 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms