Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRP4O75096 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRP4O75096 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRP4O75096 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP4O75096 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP4O75096 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP4O75096 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRP4O75096 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRP4O75096 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRP4O75096 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRP4O75096 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP4O75096 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP4O75096 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRP4O75096 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRP4O75096 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRP4O75096 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRP4O75096 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms