Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP2O75044 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP2O75044 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms