Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL4O60488 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms