Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN4O43707 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms