Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXC11O43248 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HOXC11O43248 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms