Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNN4O15554 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNN4O15554 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms