Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SEMA3EO15041 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEMA3EO15041 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms