Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GIPC1O14908 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms