Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFIT3O14879 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFIT3O14879 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFIT3O14879 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFIT3O14879 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFIT3O14879 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms