Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MEIS1O00470 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms