Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA2O00451 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GFRA2O00451 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA2O00451 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms