Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIK3CDO00329 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIK3CDO00329 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms