Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOC4-APOC2K7ER74 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOC4-APOC2K7ER74 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms