Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BRB1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BRB1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BRB1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BRB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BRB1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BRB1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BRB1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BRB1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BRB1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BRB1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BRB1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BRB1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BRB1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BRB1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BRB1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BRB1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BRB1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BRB1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BRB1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BRB1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BRB1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BRB1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BRB1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BRB1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BRB1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms