Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GOLGA8SH3BPF8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms