Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UPK3BL2E5RIL1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPK3BL2E5RIL1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms