Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L11C9JVI0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L11C9JVI0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms